Journée Reproductibilité en Sciences
amphi Polytech Lyon
Campus La Doua
Contexte
Cette journée "Reproductibilité en Sciences" est organisée par les Graduates Initiatives GI EIF, GI DIGITBIOMED, GI NEURO et GI BB dans le cadre du projet SFRI Graduate+ porté par l'université Claude Bernard Lyon 1.
Objectif
L’objectif de cette journée est double : confronter les regards et pratiques des disciplines sur le sujet afin de développer une réflexion interdisciplinaire sur le sens et les limites de ce concept, ainsi que sur les éléments communs ou au contraire distants selon les disciplines.
La journée comprendra des présentations suivies d'une table ronde.
Programme :
9h00-9h30 : Accueil des participants (café)
9h30-9h45 : Introduction (par l’organisation)
9h45-12h15 : Session 1
1. Benoît Pier : "Science ouverte, où en sommes nous ?" (recommandations/obligations de nos tutelles liées aux questions de reproductibilité)
2. Roberto Di Cosmo : " l'archivage, le référencement, la description et la citation des codes sources de la recherche, et l'usage de Software Heritage pour faciliter les tâches pour tous les EC/C/IGE concernés."
3. Gaëlle Leroux : "Reproducibility & replicability in neuroImaging field"
4. Stéphane Dray : "Reproductibilité en écologie (de la collecte de données à l'analyse) - bonnes pratiques (cahier de labo électronique, partage de données, suivi de version sur code/logiciel, programmation lettrée).
12h15 – 13h45 : Déjeuner
13h45 – 15h30 : Session 2
5. Yoann Lafon : "Le Challenge international C4Bio : améliorer la reproductibilité d'expérimentations servant à la caractérisation de matériel biologique"
6. Sorina Camarasu Pop : Reproductibilité computationnelle (définitions, défis, outils) – le cas de l’imagerie médicale
7. Michel Kern : Reproductibilité et HPC: bilan du 52e forum ORAP sur les questions posées par le HPC pour la reproductibilité
15h30 – 16h30 : Table ronde
- Eric Bois (CNRS, LIRIS)
- Sorina Camarasu Pop (CNRS, CREATIS)
- Ghislain Durif (CNRS, LBMC ENSL)
- Bertrand Kerautret (Univ. Lyon 2, LIRIS)
16h30 - 16h45 : Conclusions
Inscription
Dans le cadre des SFRI, la journée est ouverte à tous les étudiants, les enseignants, chercheurs et personnels de l'université et des établissements de l'ESR. La participation à cette journée est gratuite, mais l'inscription est obligatoire pour le buffet et souhaitable pour des questions d'organisation. Pour s'inscrire, vous devez remplir le formulaire d'inscription en bas de la page.
Accès
L'accès peut se faire avec le TRAM T1/T4 (arrêt condorcet) puis en se dirigeant vers le bâtiment Polytech à la Doua (RC). (voir le plan d'accès ici)
Détail des présentations avec documents et photos
Vous trouverez sur la page suivante le détail des contributions de la journée avec les photos des intervenants (dans Compte-Rendu) et les présentations en pièce jointe.
Vous trouverez aussi en fin de page un compte rendu contenant quelques éléments de réflexion supplémentaires, en particulier sur la reproductibilité computationnelle.
Le comité d’organisation :
Marc Buffat, Emmanuel Desouhant, Mohand-Saïd Hacid, Emiliano Macaluso
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Président de session: M. Emiliano MACALUSO (NeuroSciences)
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Président de session: M. Emmanuel DESOUHANT (LBBE)
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Mathurin Massias (CNRS, LBMC ENSL) et Ghislain Durif (CNRS, LBMC ENSL)
présentation de Computo, un journal de la Société française de statistiques promouvant la reproductibilité
Computo: an academic journal in statistics and machine learning promoting reproducibility and alternative publication mode -
Bertrand Kerautret (Pr Lyon 2, LIRIS) et ERIC Bois (CNRS, LIRIS)
minisynthèse sur les points liés à l’axe Recherche Reproductibilité :
Initiateur et organisation de la série des Workshop RRPR: https://rrpr2022.sciencesconf.org
Orateurs: M. Bertrand Kerautret (Lyon 2, LIRIS), M. Eric Bois (CNRS, LIRIS), M. Ghislain Durif (CNRS, LMC ENSL), Mme Soriba Camarasu (CNRS, Creatis) -
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